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Comme l'indique l'article 3 du décret du 21 février 1995, "les activités du Comité national d'évaluation font l'objet d'un rapport d'ensemble adressé annuellement au Président de la République ; en outre le Comité dresse, à la fin du mandat de ses membres, un bilan de synthèse sur l'état de l'enseignement supérieur".
Ainsi conformément à l'usage institué depuis les débuts du Comité, le rapport au Président de la République est, en année paire, essentiellement un rapport d'activité. En année impaire, le rapport du Comité est davantage un bilan de synthèse sur l'état de l'enseignement supérieur en France.

Le dernier rapport en ligne :

"Nouveaux espaces pour l'Université" - rapport au Président de la République (2000-2004)

Où va l'Université ? (1987)
Rapport au Président de la République (1988)
Priorités pour l'Université (1989)
Rapport au Président de la République (1990)
Universités : les chances de l'ouverture (1991)
Rapport au Président de la République (1992)
Universités : la recherche des équilibres (1993)
Rapport au Président de la République (1994)
Évolution des universités, dynamique de l'évaluation (1995)
Rapport au Président de la République (1996)
Les missions de l'enseignement supérieur : principes et réalités (1997), la Documentation française
Rapport au Président de la République (1998)
Enseignement supérieur : autonomie, comparaison, harmonisation (1999), la Documentation française
Repères pour l'évaluation - rapport au Président de la République (2002) + annexes
"Nouveaux espaces pour l'Université" - rapport au Président de la République (2000-2004)